به موجب قانون تغيير نام وزارت راه به وزارت راه و ترابري مصوب تير ماه 1353، فعاليت‌هاي مرتبط با حمل و نقل كشور ابتدا توسط سازمان هماهنگي ترابري كشور و در تشكيلات بعدي وزارت راه و ترابري به معاونت حمل و نقل محول گرديد. در تاريخ 15/8/73 بر اساس ماده يك مصوبه شوراي عالي اداري با ادغام وظايف معاونت حمل و نقل وزارت راه و ترابري با وظايف و اختيارات شركت سهامي خاص پايانه‌هاي عمومي وسايل نقليه باربري، سازمان حمل و نقل و پايانه‌هاي كشور ايجاد گرديد. در مصوبه مذكور، دلايل ايجاد سازمان به شرح ذيل ذكر شده است .

- نيل به اهداف برنامههاي توسعه اقتصادي، اجتماعي و فرهنگي جمهوري اسلامي ايران

- محدود كردن منطقي مراجع تصميم‌گيري و سياست‌گذاري

- برقراري ارتباط بين مراجع تصميم‌گيري

- تجديد تشكيلات با رعايت تجانس

- تقليل هزينه‌ها

- ايفاي وظايف مربوط به اعمال حاكميت دولت

- اصلاح ساختار تشكيلاتي و نيروي انساني بخش حمل و نقل جاده‌اي